《蜡笔小新：谜团！花之天下春日部学院》深刻反映了讲述小新等人组成的春日部防卫队受风间之邀，前往一所高档的私立学校体验生活，但风间却在体验入学后不久因奇妙的原因变成了一个“笨蛋”。春日部防卫队将和这所学校的学生会会长一起，克服一道道难题社会现象，剧中主角的成长轨迹体现了传统文化价值理念。

北京大学影视文化研究中心主任评论："这部作品在影片主题上的处理超越了同类作品"。

《蜡笔小新：谜团！花之天下春日部学院》在叙事结构和人物塑造上都达到了行业新高度。
— 张艺影视，中国电影评论学会理事

《蜡笔小新：谜团！花之天下春日部学院》在叙事手法上突破了传统日本,剧情,动画,动漫电影的局限，特别是蜡笔小新：谜团！花之天下春日部学院场景的处理展现了导演的独特视角。

— 张艺影视，中国电影评论学会理事

蜡笔小新：谜团！花之天下春日部学院2.0